王琳 ¹ , 杨伊如 ¹ , 刘艳秋 ² , 杨柳慧 ¹ , 刘彧 ¹ , 周蕴薇 ^1*

1 东北林业大学园林学院, 哈尔滨, 150040; 2 江西环境工程职业学院, 赣州, 341000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2018年12月16日    接受日期: 2018年12月24日    发表日期: 2020年05月18日

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为揭示露地菊生长发育及耐盐胁迫的应答机制和分子基础，本研究以盐胁迫处理的露地菊及其对照为材料，使用 Illumina Hiseq2500 高通量测序平台对转录组进行测序，分别获得了 60 370 448 和 71 415 448 条Clean reads，通过序列拼接组装得到 45 591 条 Unigene，平均长度 724 bp。有 37 675 条 Unigene 在七大数据库(COG, GO, KEGG, KOG, Pfam, Swiss-Prot, NR)中得到注释。通过比对露地菊盐胁迫处理组和对照组样品间 Unigene 的表达量及在各数据库中的注释情况，统计得到：有 4 143 条差异表达基因获得注释；有 2 441 条差异表达基因在 GO 数据库中获得功能注释；注释到 COG 数据库中的 2 281 条差异表达基因依据功能可分为 25 类；有 1 062 条差异基因映射到 KEGG Pathway 数据库中，涉及了 199 个代谢通路，包括核糖体途径、植物激素信号传导途径、淀粉蔗糖代谢、碳代谢、氨基酸的生物合成等。本研究获得的转录组数据将有助于揭示露地菊生长发育及耐盐胁迫的应答机制和分子基础，及相关抗性基因的挖掘和分子辅助育种等方面的研究。
 

露地菊(Chysanthemum×grandiflora)；转录组测序；盐胁迫； 基因注释；抗逆基因