研究报告

毛竹中黄酮 -C- 糖基转移酶基因的克隆和生物信息学分析  

赵蕾 , 郭雪峰 * , 邵思越 , 陈丹丹
国际竹藤中心,国家林业局竹藤科学与技术重点实验室,北京, 100102
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2018年12月24日    接受日期: 2018年12月31日    发表日期: 2020年05月27日
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摘 要

糖基转移酶是催化黄酮糖苷形成的关键酶。黄酮糖苷类化合物具有抗氧化、清除自由基、调节血脂和血糖等生理作用。基于毛竹基因库测序的完成,本研究通过 RT-PCR 技术首次获得一条完整的毛竹黄酮 -C- 糖基转移酶基因开放阅读框,将其命名为PeCGT,其基因的序列长度是 1 342 bp。对其编码蛋白的理化性质、保守结构域以及二级结构和空间结构等进行了生物信息学分析。结果表明:PeCGT 基因编码的蛋白含有 447 个氨基酸,分子量是 47.76 kD,理论等电点为 4.91,酸性氨基酸(Asp+Glu)个数为 54,碱性氨基酸(Arg+Lys)个数为 35PeCGT 蛋白是疏水型蛋白,不存在信号肽,存在于线粒体中。结构域预测分析结果表明,PeCGT 编码的氨基酸序列具有明显的糖基转移酶特征的保守域结构 PSPG。通过同源性分析,其与乌拉图小麦(Triticum urartu)、节节麦(Aegilops tauschii subsp. Tauschii)和二穗短柄草(Brachypodium distachyonhiihii)具有较高的同源性。实时荧光定量 PCR结果表明:PeCGT 基因在叶中的表达量最高,在根中几乎不表达,在茎中有部分表达。此研究结果为以后毛竹黄酮 -C- 糖基转移酶的表达和功能鉴定提供了一定的帮助。
 

关键词
毛竹(Phyllostachys edulis);黄酮 -C- 糖基转移酶;基因克隆;生物信息学分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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