1 云南农业大学植物保护学院, 昆明, 650201; 2 昆明学院农学院, 云南省都市特色农业工程技术研究中心, 昆明, 650214; 3 云南省农业科学院农业环境资源研究所, 昆明, 650205
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 14 篇
收稿日期: 2018年12月14日 接受日期: 2019年01月23日 发表日期: 2020年02月12日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 14 篇
收稿日期: 2018年12月14日 接受日期: 2019年01月23日 发表日期: 2020年02月12日
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摘 要
分离和分析花魔芋的抗病基因同源序列(resistance gene analogs, RGAs),为魔芋抗病相关基因的克隆和分析提供了机遇。本研究利用生物信息学手段,参考已知植物抗病基因的 NBS-LRR 类保守结构域筛选并合成了 4 对简并引物,从花魔芋的基因组 DNA 中扩增出 4 条 NBS-LRR 类抗病基因同源序列。序列分析表明,这 4 条 RGAs 序列均不同程度地含有 NBS 保守域的典型特征。Blast X 分析发现,获得的 4 条魔芋RGAs 与已知植物 RGAs 的氨基酸序列相似性为 55%~76%。同源进化分析表明,这些魔芋 RGAs 均属于non-TIR-NBS-LRR 类且可以分成 3 个亚类。本研究通过分子克隆技术获得花魔芋的抗病基因同源序列,为利用同源克隆技术克隆魔芋抗病基因作出探讨,为培育抗病新品种及抗病转基因育种提供参考。
关键词
魔芋;NBS-LRR;抗病基因同源序列