研究报告

水稻OsRSH基因家族的生物信息学分析  

杜丽峨1 , 黄进2 , 王丽1 , 梁欢1 , 金小琬1 , 陈稷1*
1 四川农业大学农学院, 成都, 611130; 2 成都理工大学环境学院, 成都, 610059
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2018年12月11日    接受日期: 2019年01月10日    发表日期: 2020年03月17日
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摘 要

鸟苷()四磷酸,即(p)ppGpp (Guanosine tetraphosphate and pentaphosphate),是两类相关核苷酸ppGpp pppGpp 的总称,普遍存在于植物中。环境中光照、盐、PHUV、植物激素等条件的变化会引起植物中(p)ppGpp 水平的改变。植物中(p)ppGpp 的合成和水解是由一类叫 RSH (RelA/SpoT homolog)的蛋白来完成。有研究发现 RSH 与植物生长、基因表达及胁迫应答等密切相关,且不同植物中 RSH 蛋白的种类、结构和表达方式各有不同。本研究利用 InterproClustal OmegasplitstreePlant CARERice xpro 等生物工具,分别对水稻 RSH 家族各成员的蛋白结构进行比较,对它们在光照应答、组织特性表达和激素应答过程中存在的特异性和差异性进行系统的分析,对它们在植物体内的生物功能进行了初步的解析和预测。我们发现水稻OsRSH 和拟南芥 AtRSH 在结构、功能和表达上具有高度相似性,在组织呈现特异性表达,参与激素应答过程,为今后深入开展水稻 RSH 基因家族的功能研究提供了一定的依据。

关键词
水稻(Oryza sativa);RSH;组织特性表达;激素应答;生物信息学分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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