1 云南农业大学植物保护学院, 昆明, 650201; 2 红河学院生命科学与技术学院, 蒙自, 661199
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 8 篇
收稿日期: 2018年11月28日 接受日期: 2019年01月02日 发表日期: 2020年03月17日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 8 篇
收稿日期: 2018年11月28日 接受日期: 2019年01月02日 发表日期: 2020年03月17日
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摘 要
朱顶红褪绿环斑病毒(Hippeastrum chlorotic ringspot virus, HCRV)是番茄斑萎病毒属(Orthotospovirus)新病毒,其流行及扩张速度极快。NSs 蛋白是 HCRV 编码的非结构蛋白,在 Orthotospovirus 其他病毒中,NSs 蛋白被证明在病毒侵染寄主的过程中发挥重要作用,但在 HCRV 中,NSs 功能尚不明确。本研究分析和预测了 HCRV 的性质和功能,结果表明:26 种 Orthotospovirus 属病毒的 NSs 蛋白氨基酸序列相似性不高,在进化过程中保守性较低;HCRV NSs 蛋白是酸性稳定的亲水蛋白,无信号肽,可能具有一段跨膜区域,属于 Bunya_NSs-2 超家族。该蛋白二级结构以无规则卷曲为主,功能预测显示该蛋白可能具有磷酸化酶作用,并且可能与物质在寄主体内的运动相关。本研究结果为进一步研究 NSs 的作用机制以及分析 HCRV 的快速流行原因提供一定的参考。
关键词
NSs;朱顶红褪绿环斑病毒;结构;功能;生物信息学