刘欣雨^1,2 , 魏宇昆^3* , 李桂彬³

1 上海交通大学生命科学技术学院, 上海, 200240; 2 中国科学院植物生理生态研究所, 上海, 200032; 3 上海辰山植物园, 上海, 201602
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 26 篇   
收稿日期: 2018年11月22日    接受日期: 2019年01月04日    发表日期: 2020年04月05日

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唇形科(Lamiaceae)鼠尾草属(Salvia)是一个具有丰富物种和高度多样性的类群，具有很高的科学研究与经济价值。该属可利用的通用 SSR 引物有限，因而从其代表物种丹参(Salvia miltiorrhiza)中开发新的通用性好的 SSR 引物十分必要。本研究利用丹参的 15.99 Mb 转录组数据，分析了含有 Unigene的 33 438 条序列，共获得 2 095 个 SSR 候选位点，其包括了 570 个等位基因，每个位点的等位基因数范围在 2~18 个，平均每个位点 7.92 个。多态信息含量(PIC)范围在 0.049 至 0.936 之间，平均为 0.707。根据设定条件选取了 150 个产物大小介于 100~200 bp 的引物，对属内 20 个物种进行通用性与多态性的检测，成功开发出通用性好，多态性丰富的 72 对引物。这些验证物种代表了鼠尾草属的 3 个不同亚属，可用于属内物种的遗传关系及其生态遗传学研究，具有较广泛的利用前景。

丹参(Salvia miltiorrhiza)；鼠尾草属；SSR 引物；通用性；转录组