研究报告

低温胁迫处理对甘蔗转录因子表达的影响  

唐仕云 1* , 杨丽涛2* , 李杨瑞1,2 , 杨荣仲1 , 王伦旺1 , 吴建明1
1 广西壮族自治区农业科学院甘蔗研究所, 南宁, 530007; 2 广西大学, 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 南宁, 530005
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 10 篇   
收稿日期: 2018年11月26日    接受日期: 1970年01月01日    发表日期: 2020年05月25日
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摘 要

为探明低温胁迫处理对不同甘蔗转录因子表达的影响,以‘桂糖 08-1180’和‘ROC22’为试验材料,进行低温和常温处理,经转录组测序后,对转录因子基因的差异表达进行了分析。结果表明:测序共获得 360 404 Transcripts183 515 Unigenes。低温胁迫下‘桂糖 08-1180’获得了 566 个差异表达转录因子基因,隶属于 61 类转录因子家族。‘ROC22’获得了 769 个差异表达转录因子基因,隶属于 71 类转录因子家族。2 个品种的差异表达转录因子基因表现为上调表达基因数多于下调表达基因数。ROC22 MYB、AP2-EREBPGRASWRKYNACOrphansbZIPFAR1C3HC2H2 等家族中具有较多的转录因子基因:‘桂糖 08-1180’在 AP2-EREBPWRKYMYBOrphansbZIPNACGRASC2H2FAR1bHLH 等家族中具有较多转录因子基因。有 60 个转录因子家族包含了 2 个品种的差异表达转录因子基因,而 BES1CAMTACPP 等仅含有‘ROC22’的差异表达转录因子基因,CSD 仅含有‘桂糖 08-1180’的差异表达转录因子基因。从差异表达倍数来看,2 个品种中均以表达倍数在 10 倍以下的转录因子基因最多。在‘ROC22’中,差异倍数较大的转录因子主要分布在 AP2-EREBPTify WRKY 家族,在‘桂糖 08-1180’中,差异倍数较大的转录因子主要分布在 MYBWRKY AP2-EREBP 家族。本研究为甘蔗抗寒相关转录因子的挖掘及甘蔗抗寒性机理研究提供帮助。
 

关键词
甘蔗(Saccharum L.);低温胁迫;转录因子
《分子植物育种》印刷版
• 第 18 卷
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