李军^1* , 李白² , 李斌³ , 陆其华⁴

1 嘉兴职业技术学院, 嘉兴, 314036; 2 浙江省嘉兴市农业科学研究院(所), 嘉兴, 314016; 3 嘉兴市种植技术推广总站, 嘉兴, 314050; 4 嘉兴市李子园艺科学研究所, 嘉兴, 314011
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《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18卷, 第 27 篇   
收稿日期: 2018年11月22日    接受日期: 2018年11月28日    发表日期: 2020年02月17日

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为开发槜李 EST-SSR 标记，本研究利用 MISA 软件筛选了槜李花转录组测序获得的 35 584 条Unigenes，对其 SSR 信息进行分析后，利用 Primer Premier 3.0 软件设计 EST-SSR 引物，并随机选取 40 对SSR 引物对 12 个李品种进行 EST-SSR 引物筛选及多态性分析。结果发现，在槜李花转录组中共搜索到个10 791 个 SSR 位点，分布于 8 433 条 Unigenes，SSR 发生频率为 23.70%，平均每 3.71 kb 含有 1 个 SSR；SSR 重复基元中二核苷酸重复出现频率最高，占总 SSR 数量的 52.98%，其次为三核苷酸重复(占 24.00%)和单核苷酸重复(占 20.95%)；二核苷酸重复基元以 AG/CT 为主(85.95%)，三核苷酸重复基元以 AAG/CTT为主(31.24%)。利用 Primer Premier 3.0 软件共设计出 9 870 对候选引物，随机选择 40 对引物对 12 个李品种进行 SSR 引物筛选及多态性分析。40 对引物均能扩增出预期大小的条带，有效扩增效率为 100%，40 对引物中有 5 对引物在 12 个李品种中表现出多态性。本研究开发的 EST-SSR 标记可为李属植物遗传多样性分析提供丰富的候选标记，同时可为槜李发育相关功能基因定位、遗传图谱构建、及分子标记辅助育种等研究提供帮助。

槜李(Prunus salicina)； 转录组；EST-SSR