刁雨辰¹ , 李沛欣¹ , 郭凤根^1* , 王仕玉² , 李娟¹

1 云南农业大学农学与生物技术学院, 昆明, 650201; 2 云南农业大学园林园艺学院, 昆明, 650201
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《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 23 篇   
收稿日期: 2018年11月22日    接受日期: 2018年12月28日    发表日期: 2020年04月07日

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本研究对岩白菜转录组测序获得的 94 755 条 Unigene 用 MISA 软件进行 SSR 位点挖掘和分析，共获得 10 237 个 SSR 位点，SSR 出现频率为 10.80%，所有的 SSR 位点分布于 9 001 条 Unigene 上，发生频率为 9.50%；二核苷酸(72.31%)分布最多，其次是三核苷酸(22.29%)，主导的重复基元类型是 AG/CT。利用Primer 5.0 进行引物设计，随机筛选 100 对引物进行验证，有 60 对可以扩增出与预期大小相符的条带，且多态性较好。结果表明基于岩白菜转录组序列开发 SSR 标记是可行的，这些 SSR 引物的开发有助于岩白菜的遗传多样性分析和分子标记辅助育种。

岩白菜(Bergenia purpurascens)；转录组；SSR 位点特征；SSR 引物开发