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《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 9 篇
收稿日期: 2018年10月26日 接受日期: 2018年11月02日 发表日期: 2020年02月16日
WRKY 转录因子是植物最大的转录调节子家族之一,是信号网络不可缺少的部分。本研究基于前期从中间锦鸡儿筛选鉴定的 53 条含有完整 WRKY 结构域的 CiWRKYs 基因序列,利用生物信息分析手段对其中 28 个具有完整开放阅读框 CiWRKYs 的理化性质进行研究,并与豆科植物和拟南芥的 WRKYs 转录因子的同源性和进化特征进行比较分析,同时对干旱和盐胁迫条件下蒺藜苜蓿和中间锦鸡儿中同源WRKYs 的表达模式进行了比较分析。理化性质分析结果显示 28 个 CiWRKYs 的各个氨基酸的组成在各类Group 和亚族之间没有明显的规律,脂肪系数范围为 37.61~74.76,平均亲水系数均小于 0,在 -1.269 至-0.545 之间,表明都属于亲水性蛋白。相似性比对结果表明 28 个 CiWRKYs 蛋白序列与拟南芥 WRKYs 的相似性较低,与豆科植物 WRKYs 相似性相对较高,Group芋类的 3 个成员 CiWRKY30、CiWRKY70-1 和CiWRKY75-1 均与拟南芥中同源的 WRKYs 的相似性较低。系统发育树结果显示中间锦鸡儿与蒺藜苜蓿在进化进程中的距离可能较近。表达模式分析比较显示,蒺藜苜蓿中对干旱响应显著的 6 个 WRKYs 与中间锦鸡儿的同源 WRKYs 基因有类似的表达趋势;而在盐胁迫条件下,蒺藜苜蓿根部受盐胁迫上调的 8 个WRKYs 中有 7 个同源基因在中间锦鸡儿的地上组织中对盐胁迫有不同的响应。通过本研究分析挖掘的中
间锦鸡儿潜在、特有的 WRKYs,可以优先选择开展进一步的功能研究。