研究报告

中间锦鸡儿WRKY蛋白与豆科等植物同源蛋白的比较分析  

万永青 1 , 万东莉 2 , 柳金华 1 , 王瑞刚 1 , 李国婧 1*
1 内蒙古农业大学生命科学学院, 内蒙古自治区植物逆境生理与分子生物学重点实验室, 呼和浩特, 010018; 2 中国农业科学院草原研究所, 农 业部草地生态与修复治理重点实验室, 呼和浩特, 010010
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 9 篇   
收稿日期: 2018年10月26日    接受日期: 2018年11月02日    发表日期: 2020年02月16日
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摘 要

WRKY 转录因子是植物最大的转录调节子家族之一,是信号网络不可缺少的部分。本研究基于前期从中间锦鸡儿筛选鉴定的 53 条含有完整 WRKY 结构域的 CiWRKYs 基因序列,利用生物信息分析手段对其中 28 个具有完整开放阅读框 CiWRKYs 的理化性质进行研究,并与豆科植物和拟南芥的 WRKYs 转录因子的同源性和进化特征进行比较分析,同时对干旱和盐胁迫条件下蒺藜苜蓿和中间锦鸡儿中同源WRKYs 的表达模式进行了比较分析。理化性质分析结果显示 28 CiWRKYs 的各个氨基酸的组成在各类Group 和亚族之间没有明显的规律,脂肪系数范围为 37.61~74.76,平均亲水系数均小于 0,在 -1.269 至-0.545 之间,表明都属于亲水性蛋白。相似性比对结果表明 28 CiWRKYs 蛋白序列与拟南芥 WRKYs 的相似性较低,与豆科植物 WRKYs 相似性相对较高,Group类的 3 个成员 CiWRKY30CiWRKY70-1 CiWRKY75-1 均与拟南芥中同源的 WRKYs 的相似性较低。系统发育树结果显示中间锦鸡儿与蒺藜苜蓿在进化进程中的距离可能较近。表达模式分析比较显示,蒺藜苜蓿中对干旱响应显著的 6 WRKYs 与中间锦鸡儿的同源 WRKYs 基因有类似的表达趋势;而在盐胁迫条件下,蒺藜苜蓿根部受盐胁迫上调的 8 WRKYs 中有 7 个同源基因在中间锦鸡儿的地上组织中对盐胁迫有不同的响应。通过本研究分析挖掘的中
间锦鸡儿潜在、特有的
WRKYs,可以优先选择开展进一步的功能研究。

关键词
中间锦鸡儿(Caragana intermedia); WRKY; 豆科植物;同源蛋白;生物信息学
《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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