内蒙古农业大学农学院, 呼和浩特, 010019
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 3 篇
收稿日期: 2018年10月25日 接受日期: 2018年10月31日 发表日期: 2020年02月16日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 3 篇
收稿日期: 2018年10月25日 接受日期: 2018年10月31日 发表日期: 2020年02月16日
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摘 要
MYB 基因家族是植物中最大的一类转录因子家族,广泛参与植物的生长发育和代谢调控过程。本研究通过生物信息学方法对美国国立生物技术信息中心(national center for biotechnology information, NCBI)中筛选的 16 条马铃薯 MYB 基因进行分析,预测其分子量和等电点等理化性质、基序、二级结构和三级结构,并用 MEGA 5.0 与已报道具有明确功能的 20 个 MYB 蛋白进行多序列比对分析并构建系统进化树。结果表明:马铃薯中筛选出 16 个的 MYB 基因蛋白大小在 104~379 aa,分子量和等电点分别介于 66 877.11~147 918.09 kD 和 4.95~5.16 之间;基序预测得到 3 个特征基序,最长的基序含 50 个氨基酸;α- 螺旋和无规则卷曲是主要的二级结构,三级结构中都含有螺旋 - 转角 - 螺旋结构;进化树分析中,其中 StMYB12 与SIMYB12 同源性高,StMYBA1、StAN1 和 StMYB113 与矮牵牛 AN2 同源性高,StMYB21 与 MdMYB1 有同源性,推测马铃薯的 StMYB12、StMYBA1、StAN2、StAN1、StMYB113 和 StMYB21 可能参与花青素合成代谢调控,这为下一步马铃薯花色素苷合成调控相关 MYB 基因功能研究提供参考依据。
关键词
马铃薯(Solanum tuberosum);MYB;转录因子;序列分析