季磊 , 杨艳梅^*

华北理工大学理学院, 唐山, 063210
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2018年10月25日    接受日期: 2018年10月31日    发表日期: 2019年12月14日

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开花是植物由营养生长转为生殖生长的一个标志，鳞状启动子结合蛋白样(squamosa promoterbinding protein-like, SBP)是一类重要调控开花相关的基因。在 8 个十字花科基因组中对 SBP 进行比较分析，鉴定了每个基因组中 SBP 的同源拷贝，每个基因组中基因拷贝数存在显著差异，其中最多的是在甘蓝中，有30 个基因；一个突出的发现是在四倍体基因组中不同亚基因组的 SBP 具有一定的偏性，如四倍体芥菜 -A基因组 SBP 拷贝数(21)高于芥菜 -B 基因组(19)，在四倍体欧洲油菜中 A 基因组的 SBP 拷贝数(23)高于芥菜-A 基因组(21)，但低于欧洲油菜 -C 基因组中拷贝数(25)。搜索 SBP 处于共线性区域上基因，发现不同的全基因组加倍事件都有利于家族基因拷贝数扩增，尤其是十字花科共有的古老加倍(茁)，拟南芥、萝卜、黑芥等 6 个基因组的 SBP 基因几乎都与 茁 加倍关联的重复区域相关联；另外串联重复加倍对于家族基因扩增也具有重要作用。对系统发育进行分析，并对同一事件的同义核苷酸置换率(Ks)进行比较，发现甘蓝、萝卜进化速率可能比白菜快；另外一个重要的发现是四倍体亚基因组 A 中 SBP 的进化速率快于另外的 B 和 C 基因组。本研究为认识十字花科开花相关转录因子 SBP 进化提供了重要的基因组学基础，有助于今后的更深入研究。

十字花科；鳞状启动子结合蛋白样； 开花相关基因； 全基因组加倍；基因丢失