研究报告

桑树bHLH转录因子家族全基因组鉴定与分析  

惠甜 , 沈兵琪 , 王连春 * , 卜晓真 , 邓浪 , 包昌艳 , 周凡 , 李辰晖
1 西南林业大学林学院, 西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室, 昆明, 650224; 2 西南林业大学, 西南山地森林资源保育与利用省部 共建教育部重点实验室, 昆明, 650224
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 11 篇   
收稿日期: 1970年01月01日    接受日期: 1970年01月01日    发表日期: 2019年12月14日
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摘 要

本研究旨在鉴定桑树 bHLH 基因,并分析预测其理化性质和保守结构域,以期为研究 bHLH 转录因子在桑树的生长发育、抗逆胁迫以及信号转导过程中的作用提供参考。本研究使用桑树全基因组数据,通过生物信息学方法对桑树的 bHLH 转录因子进行了鉴定与系统分析。结果表明,在桑树全基因组中共鉴定出 173 bHLH 转录因子,经过系统进化分析,将其分为四个进化大组,11 个亚组;bHLH 转录因子间理化性质差别和跨度较大,59.1%的等电点小于 7,呈弱酸性;保守结构域分析表明,bHLH 转录因子有两个高度保守的结构域并含有 H5-E9-R13 保守序列,N 端的碱性氨基酸区与 DNA 结合位点有关,C 端的 HLH 区形成螺旋 - 环 - 螺旋结构并且与形成二聚体有关,共含有 5 种保守元件;保守元件分析表明,bHLH 基因家族只含有一个 HLH 保守结构域结构;蛋白互作分析结果表明,相似的功能或者相近的生理过程可能由不同的蛋白控制。鉴定和分析桑树 bHLH 转录因子家族,既可以为桑树的抗旱、胁迫等方面的研究提供分子生物学理论基础,又可以为分子改良桑树品种提供理论依据,从而改良桑椹的果实品质,进一步提高桑椹的食用价值和药用价值。

关键词
桑树(Morus notabilis;bHLH 转录因子;生物信息学分析; 全基因组鉴定; 蛋白质互作
《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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