张金兰¹ , 张博¹ , 黄东益¹ , 肖勇² , 吴文嫱¹ , 许云¹ , 黄小龙¹ , 夏薇¹

1 海南大学热带农林学院, 海口, 570100; 2 中国热带农业科学院椰子研究所, 文昌, 571300
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2018年10月17日    接受日期: 2018年11月20日    发表日期: 2019年05月09日

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大薯属于薯蓣科薯蓣属，是热带和亚热带地区的一种重要的粮食作物，但其基础研究还较为薄弱。本研究基于公布的大薯转录谱序列和基因组序列，开展了对大薯 ERF 家族基因的挖掘和特征分析。共找到DaERF 基因 41 个，其中 14 个 DaERF 有一个以上的外显子，其余的均为一个外显子。进一步的 blastx 分析发现 30 个 DaERF 基因具有保守的 AP2 结构域，依据 AP2 序列构建系统进化树，可将其分成 5 个亚家族。通过对 AP2 结构域的两个保守 motif 的位置和结合位点的分析，发现相同家族的 ERF 蛋白具有相似的结构特征。根据大薯转录谱分析 DaERF 在不同组织中的表达，发现一些 DaERF 的表达具有组织特异性，并且属于同一亚家族基因的表达具有相似性。我们对在块茎中具有高表达的 DaERF-DaERF24 基因，使用 RT-PCR验证其在不同组织的表达，结果与转录谱数据一致。本研究通过对大薯 ERF 转录因子家族特性的初步挖掘，为以后研究ERF 家族全基因分布、ERF 基因功能验证和薯块生长发育机理提供依据。

大薯(Dioscorea alata L.)；ERF；基因家族