贵州师范大学生命科学学院, 贵州省植物生理与发育调控重点实验室, 贵阳, 550001
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 3 篇
收稿日期: 2018年09月26日 接受日期: 2018年11月09日 发表日期: 2019年03月27日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 3 篇
收稿日期: 2018年09月26日 接受日期: 2018年11月09日 发表日期: 2019年03月27日
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摘 要
磺基转移酶基因是一个基因超家族,它对植物的生长发育和抗病等方面有着重要的作用。为了研究OsCST5 (LOC_Os08g20130)在水稻中的功能,本研究对水稻OsCST5 基因进行生物信息学分析并检测其在不同组织中的表达模式。结果表明,水稻 OsCST5 基因 CDS 全长 1 008 bp,编码产物为一个含 335 个氨基酸的蛋白质,其分子量为 37 320.70。OsCST5 蛋白具有典型的磺基转移酶 -3 结构域,不存在跨膜结构域,也不含信号肽;进一步通过OsCST5 共表达基因的 GO 富集和 KEGG 富集分析,结果显示 OsCST5 共表达基因主要参与抗病反应的代谢通路,通过启动子顺式元件分析发现 sCST5 启动子区域含有抗病反应和发病相关基因的启动子结合位点。qRT-PCR 检测结果表明 OsCST5 在胚芽中的表达量最高,其次是根。综上所述,OsCST5 可能参与了水稻的抗病机制,为进一步研究 OOsCST5 在水稻中的免疫机制提供了理论依据。
关键词
磺基转移酶;OsCST5;物信息学分析;水稻