研究报告
日本蛇根草 Oj3GT1 基因的克隆与生物信息学分析 
孙威1* 
,
马玲1* ,
徐僡1 ,
申欢1 ,
鞠志刚2 ,
乙引1,3** 
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马玲1* ,
徐僡1 ,
申欢1 ,
鞠志刚2 ,
乙引1,3**
1 贵州师范大学生命科学学院, 植物生理与发育调控重点实验室, 贵阳, 550025; 2 贵阳中医学院药学院, 贵阳, 550025; 3 贵州师范大学, 西南喀斯特山地生物多样性保护国家林业局重点实验室, 贵阳, 550025
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 9 篇
收稿日期: 2018年09月26日 接受日期: 2018年10月26日 发表日期: 2019年11月05日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 9 篇
收稿日期: 2018年09月26日 接受日期: 2018年10月26日 发表日期: 2019年11月05日
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摘 要
类黄酮 3-O- 葡萄糖基转移酶(3GT)是花色苷合成途径中首个修饰酶，在花色苷合成与积累过程中起关键作用。本研究以日本蛇根草作为材料，依据其转录组信息设计 Oj3GT1 基因特异性引物，通过 RT-PCR等分子生物学方法，分离并获得 Oj3GT1 基因的完整 cDNA 序列，并对 Oj3GT1 的信号肽、功能结构域、理化参数、亲/疏水性和二级结构等进行了生物信息学分析。根据分析结果可知，Oj3GT1 基因的完整 CDS 长度为
1 377 bp，蛋白分子量为 50.922 kD，等电点为 6.20，属于亲水性蛋白质，不含有信号肽。同时二级结构分析结果显示，Oj3GT1 的蛋白二级结构主要是以不规则卷曲为主。综上所述，Oj3GT1 基因的克隆与生物信息学分析，将为日本蛇根草花色苷的生物合成研究提供科学依据，同时也为通过基因工程方法调控和改变日本蛇根草花色苷的合成提供理论支撑。
关键词
日本蛇根草(Ophiorrhiza japonica)；Oj3GT1；基因克隆；生物信息学分析
