海南大学热带农林学院, 海口, 570228
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 8 篇
收稿日期: 2019年09月17日 接受日期: 2019年10月23日 发表日期: 2019年05月09日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 8 篇
收稿日期: 2019年09月17日 接受日期: 2019年10月23日 发表日期: 2019年05月09日
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摘 要
为了进一步了解桐花树耐盐的分子机制,本研究采用 Illumina HiSeq 2000 高通量测序平台对桐花树叶片转录组进行测序,经 de novo 组装后获得 73 721 个 Unigenes,进一步利用 7 个公共数据库(NR, NT,GO, COG, KEGG, SwissProt 和 InterPro)进行比对,注释了 50 338 个 Unigenes。结果表明,有 34 991 个 Unigenes参与到 136 条 KEGG 通路上,其中在花青素和类黄酮合成途径中的 Unigenes 分别有 49 个和 176 个,这些基因可能参与了桐花树应对逆境的调控过程;此外,从转录组序列中搜索到 34 509 个 SSR 位点,其中二碱基重复出现次数最多,出现频率为 65.75%;从转录组的数据中预测到了 2 255 个转录因子,分属于 58 个家族。本研究结果为桐花树的基因功能分析、分子标记开发和遗传多样性研究提供一定的理论参考。
关键词
桐花树;高通量测序;转录组