海南大学热带农林学院, 海口, 570228
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 6 篇
收稿日期: 2018年08月27日 接受日期: 2018年09月14日 发表日期: 2019年05月15日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 6 篇
收稿日期: 2018年08月27日 接受日期: 2018年09月14日 发表日期: 2019年05月15日
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摘 要
CCR 是调控苯丙烷代谢木质素合成支路的关键酶,其活性对辣椒辣味具有重要影响,本研究通过RT-PCR 结合 RACE 法成功从海南黄灯笼椒茎尖克隆到一个全长 CCR1,并通过 DNAMAN、DNAStar 等软件与网站对该序列进行生物信息学分析,结果表明:黄灯笼辣椒 CCR1 cDNA 序列全长 1 362 bp,含有一个
840 bp 的完整的 ORF,编码 279个氨基酸;该基因编码蛋白无跨膜结构域,无信号肽,不是分泌蛋白,亚细胞定位于细胞质,为亲水蛋白;其氨基酸序列与拟南芥、巴西橡胶、番茄、烟草相似度达 79.94%,存在一个 CCR基因的典型保守序列—KNWYCYGK;CCR1 基因与番茄、马铃薯、烟草等茄科植物亲缘关系较近。这为后续进一步分析 CCR1 功能,通过调控辣椒木质素路径来提高辣椒素含量提供依据。
关键词
黄灯笼椒;CCR1;基因克隆;序列分析