研究报告

豆科植物 ARF 基因家族的比较基因组学分析  

刘润燕 , 聂仁清 , 孙仔妹 , 张岚
华北理工大学生命科学学院, 唐山, 063000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2018年08月17日    接受日期: 2018年09月20日    发表日期: 2019年08月15日
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摘 要

生长素反应因子(auxin response factors, ARF)是一类重要的调控植物生长发育的转录因子,参与生长素响应基因的表达和生长素信号转导途径等多种发育过程。本研究采用比较基因组学方法对大豆、百脉根、蒺藜苜蓿的生长素反应因子(ARF)家族的理化性质、系统发育关系、结构特性、多倍化与基因家族的关联性,以及重复基因进行分析。3 个物种中共鉴定出 129 ARF 家族基因,理化性质差异较大;系统发育分析显示全部基因被分为 4 个亚族,亲缘关系较近的基因表现出相似的结构和基序组成,选择压力分析发现有26 个位点受到正选择;另外,大豆基因组内 ARF 同源基因对的数量大于其它物种,表明全基因组加倍导致产生大量的重复基因,百脉根 ARF 同源基因对数量少于蒺藜苜蓿,证明了加倍事件伴随着重复基因的差异性丢失。这些结果将为豆科或其它物种 ARF 基因的深入研究提供一定的参考依据。

关键词
ARF;豆科;系统发育;多倍化
《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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