1玉林师范学院生物与制药学院,玉林, 537000; 2桂林师范高等专科学校,桂林, 541001
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 8 篇
收稿日期: 2018年08月10日 接受日期: 2018年08月17日 发表日期: 2020年06月17日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 8 篇
收稿日期: 2018年08月10日 接受日期: 2018年08月17日 发表日期: 2020年06月17日
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摘 要
石灰土及红壤中栽培的紫花报春苣苔的叶片生长性状及元素含量存在差异,为了从分子水平上揭示造成这种差异的原因,本研究采集在两种土壤中生长的紫花报春苣苔植株的叶片进行转录组测序,利用公共数据库注释获得的 Unigene,对差异表达基因进行 GO 及 KEGG 富集分析,以挖掘离子转运蛋白基因。研究结果表明紫花报春苣苔叶片的转录组测序共得到 176 491个 Unigene,N50值为 1 718 bp,Unigene主要以大于 500 bp的片段为主,GO功能及 KEGG分类显示紫花报春苣苔的叶片基因表达谱主要与细胞,细胞成分,细胞器组成,蛋白质翻译,物质的合成与代谢相关联。对 656个差异表达基因进行 GO、KEGG功能富集分析及基因功能注释发现,有 231个差异表达基因分别被富集到了 77条 KEGG的 Pathway中,获得了与离
子转运有关的差异表达基因共 18个,分属于 11个类别,在红壤中主要以下调表达为主,这些基因的下调表达及基因间的相互作用可能使两种土壤中紫花报春苣苔叶片的生长性状产生差别。本研究对于从分子水平上揭示紫花报春苣苔引种实验的适应机制,以及紫花报春苣苔的引种保护和开发利用具有重要意义。
关键词
紫花报春苣苔;差异表达基因;离子转运蛋白;引种试验