1 广西大学农学院, 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 南宁, 530005; 2 广西壮族自治区药用植物园, 南宁, 530023; 3 广西农业科学院微生物研究所, 南宁, 530007
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 1 篇
收稿日期: 2018年08月08日 接受日期: 2018年08月31日 发表日期: 2019年08月15日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 1 篇
收稿日期: 2018年08月08日 接受日期: 2018年08月31日 发表日期: 2019年08月15日
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摘 要
水稻细菌性条斑病是为害水稻主要的细菌性病害之一,可造成水稻显著减产。为了研究水稻对细菌性条斑病侵染响应的分子机制,通过 Illumina Hiseq 4000 平台测序,对细菌性条斑病侵染水稻叶片转录组基因的表达情况进行分析。结果表明,细菌性条斑病侵染水稻前(B_1)和侵染 20 d 后(B_2)两组出现了 10 227个差异转录基因(differentially expressed genes, DEGs),基中上调表达 9 441 个,下调表达 786 个。通过 GO 功能分类和 KEGG 富集分析,将差异基因划分为 51 个功能类别和 134 个代谢途径,包括糖酵解、淀粉与蔗糖代谢、苯丙氨酸代谢、琢- 亚麻酸代谢、植物激素信号转导、氧化磷酸化等生物学过程。研究结果为发掘与水稻抗细菌性条斑病基因相关的关键基因、遗传育种及其研究开发提供了参考和依据。
关键词
水稻;细菌性条斑病;转录组分析