1 云南省农业科学院粮食作物研究所, 昆明, 650205; 2 云南省农业科学院农业经济与信息研究所, 昆明, 650205
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 2 篇
收稿日期: 2018年07月27日 接受日期: 2018年09月05日 发表日期: 2019年08月15日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 2 篇
收稿日期: 2018年07月27日 接受日期: 2018年09月05日 发表日期: 2019年08月15日
© 2019 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要
盐胁迫是制约水稻产量的主要逆境因素之一,特别是对幼穗分化期的水稻产量影响尤其显著。本研究以水稻 Affymetrix 表达谱芯片的数据为例,应用生物信息学方法进行数据挖掘,研究幼穗分化期籼稻耐盐品种 FL478 和感盐品种 IR29 在盐胁迫处理条件下的基因差异表达情况。芯片数据分析共筛选到差异倍数在 2倍及以上的基因 257 个,以 IR29 为参照,FL478 中上调基因 138 个,下调基因 119 个,主要涉及到 β-丙氨酸生物合成、木糖降解、脂肪酸 茁 氧化等生物学过程。通过这些数据挖掘,初步探讨籼稻抗盐胁迫的表达调控机理。本研究为进一步揭示籼稻耐盐性分子机制提供了科学依据。
关键词
盐胁迫;基因芯片;数据挖掘