钱慧蓉^1,2 , 陈林^1,2 , 杨国栋^1,2 , 潘婷婷^1,2 , 王贤荣^1,2

1 南京林业大学南方现代林业协同创新中心, 南京, 210037; 2 南京林业大学生物与环境学院, 南京, 210037
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《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 24 篇   
收稿日期: 2017年08月07日    接受日期: 2017年09月12日    发表日期: 2019年02月20日

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本研究采用 L9(23)正交试验设计确定短丝木犀的 SSR-PCR 最佳反应体系，同时设置 12 个不同的温度梯度优化引物退火温度；利用优化后的体系以 50 对候选 SSR 引物为对象，对 6 个短丝木犀基因组DNA 样品等量混合，进行 PCR 扩增筛选引物。结果表明，第一，短丝木犀 SSR-PCR 最优反应体系为：1.0 滋L 50ng/滋L 模板 DNA，1.0 滋L 100 滋mol/L 引物，12.5 滋L 2伊Taq PCR Master Mix，补 ddH2O 至 25 滋L；第二，DNA 混合池方法比常规的筛选方法具有效率高，实验资源消耗低的优点，可用于短丝木犀 SSR 引物的大量筛选；第三，最终筛选出 10 对具有高多态性、高稳定性且重复性好的 SSR 引物。本研究旨在建立适合短丝木犀的SSR-PCR最佳反应体系，并以 DNA 混合池为模板进行引物筛选，为短丝木犀引物的大量开发提供了一种新的途径。

短丝木犀；SSR-PCR；优化；引物筛选；基因组 DNA 混合池