熊阳阳 , 王昌命 , 罗琳莉 , 王锦^*

西南林业大学园林学院, 昆明, 650224
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 7 篇   
收稿日期: 2018年07月20日    接受日期: 2018年08月31日    发表日期: 2019年08月08日

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本研究首次采用高通量测序技术对同一株上三种不同花被类型的铁线莲‘薇安’进行了转录组测
序，构建了铁线莲的 cDNA 文库，并对转录组数据进行过滤及拼接、功能注释、基因的差异表达分析等。通过转录组测序，一共获得了 146 036 条序列，99 652 个 Unigene 基因，长度分布在 201~14 638 bp 之间，平均长度 977 bp。对聚类后得到的 Unigene 进行同源搜索和功能注释，共 9 133 个 Unigene 与七个数据库(NR, GO, NT, Pfam, KEGG, KOG, Swissprot)均具有同源性，占总数目的 9.16%。经 SSR 位点查找与分析，从检测到的99 652 个序列总数中识别出 23 035 个 SSR 位点，包含序列的 SSR 的数量有 18 243 个，总长为 129 654 975 bp。该研究结果可为铁线莲‘薇安’不同花被类型的差异基因表达及筛选和探究重被花形成的分子机制提供了科学依据。

铁线莲(Clematis florida)；单重被；RNA-seq；差异表达量