蔡诚诚¹ , 王伟莉¹ , 张杰¹ , 邓孟胜 ¹ , 黄涛¹ , 余丽萍¹ , 李立芹^1,2 , 王西瑶^1,2*

1 四川农业大学农学院, 马铃薯研究与开发中心, 温江, 611130; 2 四川农业大学, 作物科学国家级实验教学示范中心, 温江, 611130
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 2 篇   
收稿日期: 2018年07月17日    接受日期: 2018年07月25日    发表日期: 2019年05月22日

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植物 CBL 家族基因在逆境胁迫应答中具有重要功能，但在马铃薯中鲜有报道。本研究通过生物信息学方法在马铃薯基因组中筛选出 13 个 CBL 基因，并鉴定了这些基因的染色体分布、理化性质、遗传进化、序列结构和顺式作用元件等。结果发现，马铃薯 CBL 基因在染色体上的分布是不均匀的，编码区长度在642~774 bp 之间，外显子数除了 StCBL1 只含有一个以外，其余 CBLs 的外显子数多为 7~9 个；在遗传进化上，马铃薯 CBL 可分为两大组，且多与番茄 CBL 同源；通过对其编码蛋白序列进行比对，发现每个 CBL 均具有 4 个变异程度不等的 EF-hand 结构域；其含有的作用位点类型也有所差异，StCBL2/StCBL8/StCBL9 的 N端不含有常规的豆蔻酰化位点，其 C 端的核心基序 FPSV 中，缺失了可被 CIPK 磷酸化的关键丝氨酸残基；在马铃薯 CBL 基因的上游序列中发现了可以响应不同植物激素以及逆境胁迫的顺式作用元件。本研究对马铃薯 CBL 家族进行了鉴定与初步分析，可为进一步研究马铃薯 CBL 基因功能提供理论依据。

马铃薯；CBL 基因家族；逆境胁迫；生物信息学