研究报告

枣Trihelix转录因子家族生物信息学分析  

姬俏华1 , 薛宝平1 , 张新草1 , 张昊1 , 党峰峰1 , 林金辉3 , 何伟红3 , 王延峰1,2*
1 延安大学生命科学学院, 延安, 716000; 2 延安大学, 延陕西省延安红枣重点实验室, 延安, 716000; 3 福建农林大学作物科学学院, 福州, 350000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 12 篇   
收稿日期: 2018年07月10日    接受日期: 2018年07月20日    发表日期: 2019年01月22日
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摘 要

Trihelix 转录因子家族是一个在调节植物生长发育过程中起重要作用的小家族。但目前关于枣Trihelix 转录因子家族成员的报道还很少。为了明确枣 Trihelix 家族成员的基本特征也为进一步研究其基因功能。本研究利用生物信息学方法从枣全基因组数据库中鉴定出 29 个 Trihelix 成员,并对其进行染色体定位、系统进化树、保守基序和基因结构分析。研究结果表明 Trihelix 家族成员不均匀地分布在 12 条染色体上;该家族分为 5 个亚家族,分别为 GT-1、GT-2、GT酌、SIP1 和 SH4;家族成员高度保守,每个家族均具有其特殊的结构域;同一亚家族的基因结构基本相似。本研究初步明确了枣 Trihelix 转录因子家族成员的基本结构和功能,为进一步揭示其生物学功能提供理论依据。

关键词
Trihelix;枣;转录因子;生物信息学
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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