黄艳岚^1,2 , 张道微² , 董芳² , 张超凡^2* , 邹学校^1,3*

1 湖南农业大学园艺园林学院, 长沙, 410128; 2 湖南省农业科学院作物研究所, 长沙, 410125; 3 湖南省农业科学院, 长沙, 410125
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《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 24 篇   
收稿日期: 2018年07月09日    接受日期: 2018年07月18日    发表日期: 2019年07月21日

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本研究利用 Small RNA 深度测序对长沙、永州、邵阳等地采集的甘薯种质资源病毒症状样品进行鉴定，发现样品中含有与甘薯曲叶病毒同源的系列。设计引物进行 PCR 扩增，鉴定出 24 个 SPLCV-AC1 基因片段序列，经 NCBI-Blast 比对，与 10 个不同株系 SPLCV 同源性达 96%以上。为进一步获得 SPLCV 全长序列，设计背靠背引物，经 PCR 扩增、鉴定，获得 3 个 SPLCV 全长序列。系列进化分析显示，这 3 个 SPLCV 分离物聚为同一分支，其中 SPLCV (76)序列大小 2 774 bp，与甘薯乔治亚曲叶病毒中国分离物、甘薯金脉病毒具有较高同源性；SPLCV (47)序列大小 2 777 bp，与甘薯河南曲叶病毒分离物具有较高同源性；SPLCV (68)序列大小 2 832 bp，与甘薯广西曲叶病毒分离物具有 96%的同源性。以上同源系列与 Small RNA 测序显示结果相一致。本研究结果为甘薯病毒病防控提供理论依据。

Small RNA；深度测序；甘薯曲叶病毒；双生病毒；病毒鉴定