研究报告

筛选金线莲种质资源的通用 DNA 条形码序列及鉴定其混伪品  

梅瑜1,2 , 邱道寿2 , 肖深根1 , 彭淼1* , 陈栋1,3*
1 湖南农业大学园艺园林学院, 长沙, 410128; 2 广东省农业科学院作物研究所, 广东省农作物遗传改良重点实验室, 广州, 510640; 3 广东省农业科学院茶叶研究所, 广东省茶树资源创新利用重点实验室, 广州, 510640
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 43 篇   
收稿日期: 2018年07月09日    接受日期: 2018年07月25日    发表日期: 2019年09月04日
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摘 要
本研究对 32 份金线莲(Anectochilus roxburhii)种质资源的四个 DNA 条形码(ITS, rbcL, psbA-trnH, matK)基因进行 PCR 扩增及测序,从基因库下载了金线莲及其 3 种主要混伪品的 29 条序列,分析比较各序列的差异位点、信息位点、GC 含量等,并进行种内和种间的遗传距离计算,构建基于 K2P 模型的 NJ 系统发育树,综合比较不同序列的鉴定能力,最终从四个 DNA 条形码候选序列中筛选出可用于金线莲资源鉴定的通用序列。结果显示,ITSpsbA-trnH 基因序列的种内、种间的变异位点差异和遗传距离差异较大,相比rbcL 和 matK 序列具有显著优势,且 ITS 基因不仅能够快速而准确区分金线莲及其混伪品,而且能够在种内水平上区分金线莲的不同品种。因此,ITS 基因序列是较适合鉴别金线莲资源的理想条形码。所得结论与前人关于金线莲的有效成分的研究结果进行了关联,发现不同品系的金线莲所含有效成分差异较大。因此,本研究可以为金线莲的功能产品研发、优良品种选育、药理药效研究等方面提供帮助,尤其在金线莲资源选择上提供了较为理想的方法,研究具有一定的应用前景和科学价值。
关键词
金线莲(A noectochilus roxburhii);DNA 条形码;分子鉴定;ITS
《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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