董旭 , 阮成江^* , 刘祾悦 , 闫蕊 , 韩平 , 庞延

大连民族大学, 资源植物研究所, 生物技术与资源利用教育部重点实验室, 大连, 116600
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 26 篇   
收稿日期: 2018年07月09日    接受日期: 2018年07月29日    发表日期: 2019年05月24日

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文冠果(Xanthoceras sorbifolium Bunge)是中国北方重要的集药用、食用、观赏和绿化于一身的多用途经济树种。利用 MISA 软件从文冠果根、叶、花和果实高通量转录组库的 45 335 条 Unigenes 中，搜索挖掘出 12 606 个 SSR 标记。在这些 SSR 标记中，有 34.29%的单核苷酸重复、32.82%的二核苷酸重复、29.22%的三核苷酸重复、0.69%的四核苷酸重复、1.59%的五核苷酸重复和 1.39%的六核苷酸重复。Unigenes 中的 408条涉及调控文冠果花色、叶色、果实开裂、成熟期、心室数、种子生长发育、大小和粒重等目的性状，从这些目的基因中共搜索挖掘到 64 个 SSR 标记，以辽冠 1 号叶片 DNA 为模板从这些 SSR 标记中共筛选出 42 对具有清晰扩增条带的 SSR 标记。以选取的 5 份表型性状差异明显的文冠果种质叶片为材料，通过对初筛的42对 SSR 引物的多态性筛选，获得了 18 对文冠果多态性 SSR 引物。本研究利用高通量 RNA-seq 开发的文冠果目的基因 SSR 标记，可为文冠果指纹图谱构建、遗传多样性分析和标记辅助选择育种等提供分子标记，对文冠果研究和开发利用具有重要意义。

文冠果；RNA-seq；目的基因；SSR；多态性标记