福建农林大学林学院, 福州, 350002
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 16 篇
收稿日期: 2018年06月27日 接受日期: 2018年07月09日 发表日期: 2019年01月22日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 16 篇
收稿日期: 2018年06月27日 接受日期: 2018年07月09日 发表日期: 2019年01月22日
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摘 要
E2F/DP 是动植物细胞持续或停止细胞分裂中的一个重要调节因子。本研究鉴定了毛竹全基因组中的编码 E2F/DP 的家族基因,对其进行进化、结构域和表达模式进行了初步的分析,为毛竹 E2F/DP 基因的功能研究与利用提供依据。本研究首先通过生物信息学的方法从毛竹基因数据库中获得 12 个 PhE2F/DP 转录因子家族基因;通过进化分析发现毛竹 E2F/DP 转录因子家族可分为三个 E2F、DP 和 DEL 单个进化分支,具有进化上的保守性。对 PhE2F/DP 转录因子家族结构域分析发现 PhDPA 1 和 PhDPA 2 在进化中丢失了与PhE2F 分支形成二聚体的亮氨酸拉链结构域,而 PhDEL 获得了 DNA 结合结构域,暗示了毛竹细胞周期调控中 PhE2F/DP 可能发挥特异的调控功能。进一步对 PhE2F/DP 转录因子家族的表达模式发现,PhE2F/DP 家族基因在愈伤组织中只有 PhDPA 2 得到了上调表达,PhDPA 2 在分化的愈伤组织中表达。由于 PhDPA 1 和PhDPA 2 关键结构域的丢失有可能是毛竹再生困难的原因。故本研究初步对毛竹 PhE2F/DP 基因家族进行分析,揭示了毛竹 PhE2F/DP 转录因子结构域在进化中的特点,为后续深入研究毛竹再生和分子育种提供科学依据。
关键词
毛竹;E2F/DP;愈伤组织;结构域