韩平¹ , 阮成江^1* , 丁健¹ , 董旭¹ , 王海明¹ , 熊朝伟¹ , 刘文浩¹² , 王国辉²

1 大连民族大学, 资源植物研究所, 生物技术与资源利用教育部重点实验室, 大连, 116600; 2 国有阜新蒙古族自治县林业科技示范林场, 阜新,123000
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《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 27 篇   
收稿日期: 2018年06月20日    接受日期: 2018年06月28日    发表日期: 2019年07月21日

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紫斑牡丹(Paeonia suffruticosa Andr. var. papaveracea)是中国北方主栽的油用牡丹品种。基于高通量转录组测序技术(RNA-seq)，利用 MISA 软件从紫斑牡丹种子转录组库中共获得 115 922 条 Unigenes，从中挖掘出 16 900 个 SSR 标记。这些 SSR 标记中的单核酸苷酸重复占 59.14%、二核苷酸重复占 28.61%、三核苷酸重复占 11.27%、四以上核苷酸重复0.98%在涉及调控紫斑牡丹油脂合成和脂肪酸积累、种子大小和粒重及角鲨烯等目的性状相关目的基因的功能注释 unigenes 中，共搜索到 71 对 SSR 标记引物；以优良无性系DL1 叶片 DNA 为模板对这些 SSR 引物的有效性验证结果表明，共有 46 对引物能扩增出清晰的目的条带。以 7 个牡丹种质的叶片为材料，对 46 对已扩增出目的条带的 SSR 引物进行多态性验证，获得了 44 对具有多态性的 SSR 标记引物，占总引物的 95.65%。利用 RNA-seq 技术新开发的目的基因 SSR 标记可为紫斑牡丹的遗传多样性分析和标记辅助选择育种等提供科学基础。

紫斑牡丹；RNA-seq；目的基因；SSR；多态性标记