孙陶泽¹ , 母洪娜¹ , 王良桂² , 李火根²

1 长江大学园艺园林学院, 荆州, 434025; 2 南京林业大学风景园林学院, 南京, 210037
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《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 24 篇   
收稿日期: 2018年06月21日    接受日期: 2018年07月26日    发表日期: 2019年05月09日

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为解析桂花转录组数据中 SSR 的特点及潜在利用价值，本研究基于‘早银桂’和‘橙红丹桂’转录组数据信息，利用 MISA 软件从桂花的 117 595 个 Unigenes 中进行 SSR 位点的查找、分析，共检测到 16 015 个SSR位点，平均密度是 1/5.2 kb。桂花 SSR 基序 97.73%的重复次数在 5~10 次之间，重复次数最多的是 6 次(28.12%)；SSR 长度分布在 12~36 bp 之间，其中 12~16 bp 的最多，占 66.8%，其总体变化趋势是随着重复次数增加重复次数急速下降。基于已知的 SSR 位点，利用 primer3 设计引物并从中挑选出 196 对引物，其中 92对引物(占46.94%)已被注释到参与信号的转录翻译、苯丙氨酸代谢、植物激素信号转导等功能。综上所述，‘早银桂’和‘橙红丹桂’转录组 SSR 位点出现频率高，类型较丰富、多态性潜能较高，为今后桂花分子育种提供了理论依据。

桂花；转录组测序；EST-SSR