三峡大学,生物技术研究中心,宜昌, 443002
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 8 篇
收稿日期: 2018年06月06日 接受日期: 2018年07月09日 发表日期: 2019年05月24日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 8 篇
收稿日期: 2018年06月06日 接受日期: 2018年07月09日 发表日期: 2019年05月24日
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摘 要
通过同源克隆法从花魔芋抗病植株中得到抗软腐病基因的同源片段,为筛选魔芋抗软腐病基因提供了科学依据。根据已知植物NBS-LRR类抗病基因同源序列(RGA)的保守区域设计简并引物,从抗软腐病花魔芋植株的基因组 DNA与cDNA上得到抗病基因同源片段(RGAs),并对其结构进行分析。从抗软腐病花魔芋植株基因组中分离得到了一条 500 bp 的 NBS-LRR 类抗病基因同源序列,共获得 6 条特异序列,分别命名为RGAR1、 RGAR2、RGAR3、 RGAR4、 RGAR5、 RGAR6, 6 条魔芋 RGAs在氨基酸水平上的同源性表现出多态性,序列相似性分析结果表明,这些魔芋抗病基因同源序列均包含 P-loop、 Kinase-2、 Kinase-3及疏水结构域 HD等保守结构域,与已知的抗病基因在氨基酸水平上的同源性为 33%~63%。通过构建系统进化树分析,将这 6 个序列分为 3 个亚组,均属于 TIR-NBS-LRR 类抗病基因。在花魔芋上成功获得了抗病基因同源序列,将为魔芋中抗病基因的克隆、功能分析及定位等提供帮助。
关键词
花魔芋;抗病基因同源序列;NBS-LRR;同源克隆