白菜品种SSR指纹图谱数据库的构建  

张婉1 , 崔继哲1 , 于拴仓2 , 李丽2
1 哈尔滨师范大学, 哈尔滨, 150025;
2 北京市农林科学院蔬菜研究中心, 北京京研益农科技发展中心, 农业部华北地区园艺作物生物学与种质创新重点实验室, 农业部都市农业(北方)重点实验室, 北京, 100097
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 26 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000843
收稿日期: 2013年03月07日    接受日期: 2013年05月20日    发表日期: 2013年10月10日
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摘 要

本研究利用SSR标记技术筛选出合适的核心引物,对70个白菜品种进行DNA指纹分析,构建白菜SSR指纹图谱数据库。首先从500对引物中筛选出80对具有多态性的引物,再从其中选取20对多态性高,稳定性好且均匀分布在白菜10条染色体组上的核心引物进行PCR扩增,引物多态信息含量(polymorphism Information Content, PIC)平均为 0.716,变化范围0.473~0.932,平均杂合率0.504 4。经PCR电泳检测统计得到的指纹图谱进行综合分析,形成各个白菜品种的SSR指纹代码,并且采用ClusterProject对构建的指纹图谱数据进行分析整理,得到各品种的指纹模式图谱,进而分析得到20个核心引物组合可以将70个白菜品种完全分开,并最终建立了白菜品种的SSR指纹图谱数据库。本研究构建的白菜品种SSR指纹图谱数据库,为建立白菜品种特异性、一致性及纯度的鉴定技术体系提供了基础依据。

关键词
白菜;SSR;核心引物;指纹图谱
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《分子植物育种》印刷版
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