籼粳稻及恢复系Rf-1位点PCR片段序列的分析  

何婷婷1 , 文建成1,2 , 金寿林1,2 , 朱高倩1 , 徐莹洁1 , 普世皇2 , 谭学林1,2
1 云南农业大学稻作研究所, 昆明, 650201;
2 云南省杂交粳稻工程技术研究中心, 昆明, 650201
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 7 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000712
收稿日期: 2013年03月07日    接受日期: 2013年04月18日    发表日期: 2013年09月25日
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摘 要

在水稻杂种优势利用上育性恢复基因与细胞质雄性不育基因都是同等重要的关键基因。本研究利用育性恢复基因Rf-1位点上的特异性引物68923-8对来源不同的籼、粳稻恢复系及非恢复系进行PCR片段的序列比对及遗传距离分析。结果如下:籼稻非恢复系间的一致性为94.97%,籼稻恢复系间的一致性为88.03%,籼稻恢复系与籼稻非恢复系间的一致性达到91.56%;粳稻非恢复系间的一致性为91.56%,粳稻恢复系间一致性为57.48%,但粳稻恢复系与粳稻非恢复系间的一致性却较低,为36.53%;非恢复系的籼-粳稻间的一致性为57.66%,恢复系的籼-粳稻间的一致性为54.71%。遗传距离的分析也揭示与此相似的结果。聚类将籼粳恢复系和非恢复系分成三大枝:第一大枝包含籼稻恢复系、籼稻非恢复系及1个粳稻恢复系Ansanbyeo;第二大枝包含6个粳稻非恢复系;而滇Ⅰ型恢复系南34与BT型恢复系C418则单独成第三大枝,而且与其它两枝的同源性较低。结果表明:水稻籼-粳亚种的遗传分化反映在育性恢复基因Rf-1位点的DNA序列变异上。

关键词
籼粳亚种;恢复基因;Rf-1位点;PCR序列;变异
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《分子植物育种》印刷版
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