张成才 , 王丽鸳 , 韦康 , 成浩

中国农业科学院茶叶研究所, 国家茶树改良中心, 杭州, 310008
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 22 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000817
收稿日期: 2013年03月12日    接受日期: 2013年10月22日    发表日期: 2013年10月29日

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为促进SNP技术在茶树遗传育种中的应用，本研究探讨了将茶树SNPs转化成CAPS标记进行检测的可行性。首先，对从茶树ESTs中挖掘的候选SNPs进行重测序验证；然后对确证的SNPs进行限制性内切酶识别位点分析，筛选出引起酶切识别位点改变的SNPs；接着使用相应的引物从茶树基因组中扩增这些SNPs所在的片段，对扩增产物进行酶切和电泳检测，将SNPs转化为CAPS标记；最后，随机选择了14个CAPS标记，在25个茶树品种中进行多态性分析，以验证标记的可用性。研究结果经重测序验证，在8个茶树品种中共检测到162个SNPs；有39个SNPs成功转化为CAPS标记；在14个随机选择的CAPS标记中有13个在25个品种中表现出多态性，多态性信息含量(PIC)介于0.043和0.497之间，平均0.311；另外1个标记在25个品种中均为杂合。结果表明，本研究构建的将茶树SNPs转化为CAPS标记的方法，可以方便地用于茶树SNPs的检测，促进SNP技术在茶树遗传育种研究中的应用，同时本文报道的39个CAPS标记可以用于茶树遗传多态性检测和茶树遗传图谱构建等方面的研究。

茶树；EST；SNP；CAPS；遗传多态性