山西农业大学园艺学院, 太谷, 030801
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 6 篇
收稿日期: 2018年05月02日 接受日期: 2018年06月06日 发表日期: 2019年01月15日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 6 篇
收稿日期: 2018年05月02日 接受日期: 2018年06月06日 发表日期: 2019年01月15日
© 2018 BioPublisher 生命科学中文期刊出版平台
这是一篇采用Creative Commons Attribution License进行授权的开放取阅论文。只要对本原作有恰当的引用,版权所有人允许和同意第三方无条件的使用与传播。
摘 要
MADS-box 转录因子是调节植物开花的一类重要的转录调控因子。为了研究葡萄花发育相关MADS-box 基因在花器官生长发育过程中的表达特征,本试验以‘北醇’葡萄两性花生长发育过程中三个时期的花器官为试材,对其进行转录组测序分析后筛选出 4 个注释为花发育相关功能且表达水平较高的MADS-box 基因家族成员,进行生物信息分析。结果表明,4 个 MADS-box 基因均含有内含子和外显子结构,各基因 CDS 区域均较为分散,呈现断裂基因特征;对各基因进行启动子顺式作用元件分析,均包含多类花发育相关的功能元件;基于转录组结果数据,4 个葡萄 MADS-box 基因在花器官发育的三个时期均有表达,V IT_14s0083g01050 与 V IT_10s0003g02070 的表达量呈逐渐下降的趋势,而 V IT_18s0001g01760 与 V IT_15s0048g01270的表达量先上升后下降,且 V IT_18s0001g01760 在 S1 时期的表达水平显著高于其它基因;分析4 个基因基本信息及其蛋白理化性质发现,各基因结构极为相似;多物种系统进化树表明,V IT_18s0001g017-60 与黄瓜中已知花发育相关基因 CUM26 同源性最高,初步推测其可能与葡萄花发育过程具有较高相关性。本研究为 MADS-box 基因功能研究提供了理论依据。
关键词
葡萄;花发育;MADS-box 基因;转录组;生物信息分析