1 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 儋州, 571737; 2 中国烟草总公司郑州烟草研究院, 郑州, 450001
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 11 篇
收稿日期: 2018年04月20日 接受日期: 2018年05月16日 发表日期: 2019年01月22日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 11 篇
收稿日期: 2018年04月20日 接受日期: 2018年05月16日 发表日期: 2019年01月22日
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摘 要
A622 基因在烟草砒啶类生物碱生物合成中起重要作用,其在茄科植物中的起源和进化还未有报道。本研究鉴定得到该基因含有 NmrA-like 家族结构域,且该结构域几乎覆盖 A622 基因全长。通过搜索栽培烟草、番茄、辣椒,以及咖啡和拟南芥基因组,得到了 92 条 NmrA-like 家族成员。将 A622 基因与拟南芥基因单独聚类,发现拟南芥基因大体分为两大枝;与 A622 聚在一起的枝中,含有已鉴定功能的 PR 基因。通过CLANS 聚类,得到包含已知 A622 基因和拟南芥 PR 基因的 46 条基因。采用最大似然法,将此类基因进行进一步聚类,得到一个包含 A622 基因的亚家族,该亚家族含有 1 条拟南芥基因、1 条咖啡基因、2 条烟草基因以及 3 条番茄基因。本研究为将来进一步研究 A622 在茄科植物中的功能提供基础;结合对拟南芥基因(AT4G39230)的功能及关键位点鉴定,将能进一步阐明茄科植物 A622 基因的起源与进化。
关键词
A622;尼古丁;砒啶类生物碱;进化