研究报告

水稻三结构域多铜氧化酶基因家族生物信息学分析  

王有成上标1,2 , 谭炎宁上标2 , 张超上标2 , 殷小林上标3 , 何强上标2* , 肖应辉上标1* , 邓华凤上标1,2*
1 湖南农业大学农学院, 长沙, 410128; 2 湖南杂交水稻研究中心, 杂交水稻国家重点实验室, 长沙, 410125; 3 湖南大学研究生院隆平分院, 长沙, 410125
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 1 篇   
收稿日期: 2018年04月20日    接受日期: 2018年05月08日    发表日期: 2019年03月27日
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摘 要

三结构域多铜氧化酶是生物体内非常重要的金属氧化酶,对机体生长和发育具有重要影响。为了系统地了解水稻三结构域多铜氧化酶基因家族的基本情况,本研究运用生物信息学方法对其成员进行了预测和分析;研究发现,以拟南芥三结构域多铜氧化酶基因 At5g21105 为靶序列,利用 BlastP 为工具在水稻基因组中共搜索到 38 个同源基因;这些基因的蛋白产物都依次含有 Cu-oxidase_3Cu-oxidase Cu-oxidase_2三种结构域,各结构域中含有铜离子结合位点,二级结构具有 - 螺旋和 - 转角等基本特征,特推断它们都属于三结构域多铜氧化酶家族成员;进一步地,根据同源性程度将水稻多铜氧化酶基因家族成员划分为ClassClass两个亚家族,其中 Class包含 31 个基因,Class包含 7 个基因。这些研究结果为进一步研究水稻多铜氧化酶基因家族成员的功能提供了参考依据。

关键词
水稻; 多铜氧化酶; 基因家族;结构域;生物信息学分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 17 卷
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