研究报告/Research Report

渐绿木霉基因组中 PKS 和 NRPS 基因的多样性分析  

叶美金1,2 , 郭海霞1 , 杨财容1 , 薛飞龙1 , 刘红玲1,3*
1 成都师范学院, 化学与生命科学学院, 成都, 611130; 2 四川农业大学, 小麦研究所, 成都, 611130; 3 石河子大学, 生命科学学院, 石河子, 832003
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 15 篇   
收稿日期: 2017年04月18日    接受日期: 2017年05月13日    发表日期: 2018年08月07日
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推荐引用:

引用格式:Ye M.J., Guo H.X., Yang C.R., Xue F.L., and Liu H.L., 2018, Analysis of PKS and NRPS gene diversity in Trichoderma viridescens, Fenzi Zhiwu Yuzhong (Molecular Plant Breeding), 16(14): 4607-4613 (叶美金, 郭海霞, 杨财容, 薛飞龙, 刘红玲, 2018, 渐绿木霉基因组中 PKS NRPS 基因的多样性分析, 分子植物育种, 16(14): 4607-4613)

摘 要

为了探究渐绿木霉(Trichoderma viridescens)基因组中聚酮合成酶(polyketide synthase, PKS)和非核糖体多肽合成酶(non-ribosomal peptide synthase, NRPS)的多样性,为寻找合成生物活性物质的潜在菌株提供科学依据。本研究通过 18S rDNA 序列分析,鉴定菌株 SC-1 为渐绿木霉(T. viridescens);利用兼并性引物对菌株 SC-1 PKS NRPS 基因进行 PCR 扩增及序列测定分析,构建系统发育树,明确菌株 SC-1 PKSNRPS 基因序列的系统进化地位。结果表明,菌株 SC-1 基因组中含有 PKS INRPS 基因片段;经比对,PKS I 基因片段与已知 Trichoderma atroviride PKS 序列相似度为 96%NRPS 基因片段与 Trichoderma gamsiiNRPS 序列相似度为 97%。本研究结果为渐绿木霉具有产生活性次生代谢产物的潜力,值得进一步开发研究和应用。

关键词
渐绿木霉;多样性;聚酮合成酶;非核糖体多肽合成酶
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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