利用生物信息学和qRT-PCR分析鉴定水稻细菌性条斑病QTL qBlsr5a的候选基因  

谢小芳1 , 林德塨1 , 许国泉1 , 李春兰1 , 陈志伟2 , 吴为人2
1 福建农林大学生命科学学院, 福州, 350002;
2 福建农林大学作物科学学院, 福州, 350002
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 1 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000293
收稿日期: 2013年02月16日    接受日期: 2013年02月23日    发表日期: 2013年04月16日
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摘 要

细菌性条斑病(简称细条病)是水稻的主要病害之一。前期研究已将细条病抗性QTL qBlsr5a精细定位在5号染色体上一个大约300 kb的区间内。为了寻找该QTL的候选基因,本研究利用生物信息学方法对该区间进行分析,筛选出10个与抗病相关的注释基因。然后以感病品种H359及其抗病近等基因系H359-BLSR5A为材料,对细条病菌接种后这10个基因的表达动态进行qRT-PCR分析。结果表明,2个基因在抗、感材料中几乎没有检测到表达产物;7个基因对病原菌侵染没有明显的响应;1个基因(LOC_Os05g01700)在病原菌侵染后表达量发生变化且在抗、感材料间存在显著差异。因此推测,该基因是qBlsr5a的一个重要的候选基因。

关键词
细菌性条斑病;qBlsr5a;候选基因;生物信息学;qRT-PCR
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《分子植物育种》印刷版
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