研究报告

栽培种西番莲完全型SSR的高通量鉴定及标记开发  

吴艳艳 , 黄伟华 , 黄永才 , 刘洁云 , 田青兰 , 牟海飞 , 李小泉*
广西农业科学院生物技术研究所,南宁, 530007
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 27 篇   
收稿日期: 2018年04月10日    接受日期: 2018年05月10日    发表日期: 2019年01月17日
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摘 要

SSR标记具有多态性高、重复性好、共显性等特点,易被用来开发高效简单实用的分子标记。为了丰富栽培种西番莲分子标记的种类和数量,本研究利用生物信息学方法对栽培种西番莲基因组中的完全型SSR进行高通量鉴定, 获得 13 104个完全型 SSR。 SSR核心序列结构主要为 2~4个碱基,数量最多的为 TA、AT、 TC和AG,重复次数最高达到20次。利用生物信息学软件开发出12 934对SSR标记, 并选取了其中20对标记在西番莲MTX与 WJ10中进行了扩增特异性评估,结果显示多态率达 60%。西番莲栽培种SSR标记的大量开发为西番莲种质资源的高效利用、品种的遗传改良及分子育种提供了技术支持。

关键词
西番莲;完全型 SSR;高通量;分子标记
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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