滇杨优树基因组及其无性系落叶期侧芽cDNA的AFLP分析  

李里 , 江涛 , 王滨蔚 , 吴海 , 周安佩 , 刘东玉 , 何承忠
西南山地森林资源保育与利用省部共建教育部重点实验室, 西南地区生物多样性保育国家林业局重点实验室, 西南林业大学林学院, 昆明, 650224
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2013 年, 第 11卷, 第 16 篇   doi: 10.3969/mpb.011.000393
收稿日期: 2013年02月05日    接受日期: 2013年03月19日    发表日期: 2013年04月26日
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摘 要

采用AFLP分子标记技术,对采集于四川省和云南省的56株滇杨优树基因组遗传变异、54个滇杨优树无性系3a苗木落叶期侧芽的基因表达谱进行了分析。DNA-AFLP分析结果表明,筛选出的8对AFLP引物组合共扩增出508条带,平均多态性条带比率为59.25%,观测等位基因数为1.5925,有效等位基因数为1.1581,Nei’s基因多样性指数为0.1129,Shannon’s信息指数为0.1914;除有效等位基因数相等外,四川居群的4项遗传多样性指标均略高于云南居群,但2个居群之间存在着较高的基因流(Nm=21.64)。cDNA-AFLP分析结果显示,筛选出的8对AFLP引物组合共扩增出526条带,其中平均差异性条带百分率为82.70%,观测等位基因数和有效等位基因数分别为1.8270和1.2417,Nei’s基因多样性指数为0.1675,Shannon’s信息指数为0.2809;四川居群的基因表达差异性指标均略高于云南居群,且二者之间的基因流值较大(Nm=27.00)。分子方差分析(AMOVA)分析结果表明,滇杨2个居群在DNA水平和cDNA水平的遗传差异均极显著。

关键词
滇杨优树;基因组;侧芽cDNA;落叶期;AFLP标记
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《分子植物育种》印刷版
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