林兴娥¹ , 牛俊海² , 陈莹³ , 马蔚红¹ , 臧小平¹ , 葛宇¹ , 王甲水¹ , 周兆禧^1*

1 中国热带农业科学院海口实验站, 海口, 570102; 2 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所, 儋州, 571737; 3 海南大学热带农林学院, 儋州, 571737
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2018年03月21日    接受日期: 2018年03月29日    发表日期: 2019年01月24日

为建立适宜红毛丹 SSR-PCR 反应的最佳体系并筛选出具有多态性的 SSR 引物，采用 L₁₆(4⁵)正交试验设计对反应体系中的各组分(模板 DNA, 引物, Mg²⁺, dNTPs 和 Taq DNA 聚合酶)进行了优化，建立了红毛丹 SSR-PCR 的最佳反应体系(20 μL)：DNA 模板 30 ng、dNTPs 0.40 mmol/L、引物 0.4 μmol/L、Taq DNA 聚合酶 1.5 U、Mg²⁺ 1.50 mmol/L；利用优化后的 SSR-PCR 体系和 6 份红毛丹种质基因组 DNA 模板，从 50 对 SSR 引物中筛选出 11 对条带清晰、多态性丰富、重复性好的 SSR 引物，多态比例达 22%。本研究为后续红毛丹种质资源遗传多样性分析、分子指纹图谱构建和品种鉴定等研究提供了技术参考。
 

红毛丹；SSR；体系优化；引物筛选