1 周口师范学院生命科学与农学学院, 周口, 466001; 2 周口市农业科学院, 周口, 466001
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 3 篇
收稿日期: 2018年03月08日 接受日期: 2018年04月17日 发表日期: 2019年08月08日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2019 年, 第 17卷, 第 3 篇
收稿日期: 2018年03月08日 接受日期: 2018年04月17日 发表日期: 2019年08月08日
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摘 要
为获得芝麻细胞色素氧化酶喻a 亚基基因及其蛋白质序列特征,研究其组织表达特性以及可能的功能。本研究利用 NCBI 数据库中注释的芝麻 COX 喻a 基因序列,设计特异 PCR 引物,以 RT-PCR 技术进行克隆和表达分析,并利用生物信息学方法分析其序列特征,预测其蛋白质亚细胞定位、跨膜结构和三级结构等。结果表明,克隆的芝麻 SiCOX 喻a1 和 SiCOX 喻a2 基因的 cDNA 序列长度分别为 481 bp 和 416 bp,二者 编码的蛋白质序列长度为 67 个氨基酸残基,具有 88%的相似性,属于同源蛋白,均定位于线粒体中,在蛋白序列中 35~57 aa 形成一个跨膜螺旋区;预测的 SiCOX 喻a 三级结构均由 2 段 琢- 螺旋结构组成,但 SiCOX喻a2 与 SiCOX 喻a1 序列的 C 端形成的高级结构存在较小的差异。表达分析表明,二者在芝麻花蕾、花冠、根、茎和叶中均有表达,且表达模式相似,均在生长旺盛的组织中高丰度表达。本研究为揭示芝麻 COX 蛋白复合物的结构和功能提供了理论指导。
关键词
芝麻(Sesamum indicum);细胞色素 C 氧化酶;基因克隆;序列分析