1 甘肃农业大学农学院, 甘肃省干旱生境作物学重点实验室, 甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室, 兰州, 730070; 2 甘肃农业大学生命科学技术学院, 兰州, 730070
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 9 篇
收稿日期: 2018年03月15日 接受日期: 2018年04月04日 发表日期: 2019年01月17日
作者 通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 9 篇
收稿日期: 2018年03月15日 接受日期: 2018年04月04日 发表日期: 2019年01月17日
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摘 要
为了从分子生物学角度研讨盐生草耐盐机理,挖掘耐盐基因,本研究以盐生草(Halogeton glomeratus)为材料,根据盐生草转录组测序结果,利用 RT-PCR 与 SMARTer RACE 技术克隆耐盐基因 Unigene7547 的cDNA 全长,并应用生物信息学方法对该基因相关功能进行预测分析。结果克隆到 Unigene7547 基因的cDNA 全长,该基因全长 1 306 bp,开放阅读框为 1 218 bp,编码 405 个氨基酸,分子量为 45.16 kD,通过生物信息学分析显示,Unigene7547 基因编码蛋白属于亲水性蛋白,呈酸性,无信号肽及跨膜区,亚细胞定位于细
胞核内。发现 Unigene7547 中含有 Thr、Ser、Tyr 等磷酸化位点,主要以 Thr、Ser 磷酸化位点为主,可能影响细胞生理活动修饰调控等方面。Unigene7547 基因蛋白二级结构中随机卷曲为 37.78%、延伸链为 28.89%、琢 螺旋为 23.46%、茁- 转角为 9.88%。该研究结果为进一步解析盐生草耐盐机理与培育耐盐新品种具有重要意义。
关键词
盐生草;转录组;生物信息学;亲水性;亚细胞定位