研究报告

山杏CAT家族基因的生物信息学预测及表达分析  

刘力力 , 林子欣 , 胡锦赫 , 安基永 , 王佳 , 林善枝*
北京林业大学生物科学与技术学院, 北京, 100083
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 5 篇   
收稿日期: 2018年02月27日    接受日期: 2018年04月01日    发表日期: 2019年01月16日
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摘 要

CAT (Cationic amino acid transporters)作为一类跨膜转运蛋白,广泛参与植物体内氨基酸的吸收与转运。为了深入研究 CAT 家族基因在蛋白质累积过程中的调控作用,本研究以山杏(Prunus sibirica L.)果实为试材,以前期所获得的不同发育期山杏果实转录组测序数据为依据,通过功能注释与分析获得了 6 CAT家族成员基因,分别命名为 PsCAT1PsCAT2PsCAT5PsCAT7PsCAT8 PsCAT9。生物信息学分析结果表明,山杏果实 PsCAT 家族基因均含有完整的开放阅读框,可编码以 - 螺旋二级结构为主、不含信号肽的非分泌蛋白,且含有多个磷酸化位点;除 PsCAT2 蛋白外,其余 5 PsCAT 蛋白均为碱性蛋白,而除了PsCAT5 蛋白定位于线粒体外,其余均为内质网定位的强疏水性的跨膜转运蛋白。同时,采用 qRT-PCR 技术对PsCAT基因在不同发育山杏果实中的动态转录表达进行检测,结果发现,PsCAT2PsCAT5 PsCAT7 30 DAF 时表达量最高,而 PsCAT1PsCAT8 PsCAT9 60 DAF 时表达量最高;另外,PsCAT2 在不同发育山杏果实中的表达量均显著高于其它 PsCAT 基因,推测其可能在山杏果肉蛋白累积过程中起主导作用。研究结果可为
后续研究山杏果肉蛋白的累积规律及调控机理提供科研依据,具有重要的学术价值。

 

关键词
山杏果实;阳离子氨基酸转运体;家族基因;生物信息学分析;转录表达
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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