研究报告

基于 SSR 分子标记的野生山胡椒(Lindera glauca)核心种质的构建  

熊彪1 , 张莉梅1 , 哈登龙2 , 琚煜熙2 , 张志翔1*
1 北京林业大学树木系统进化与生物地理学研究室, 北京, 100083; 2 河南鸡公山国家级自然保护区管理局, 信阳, 464000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 24 篇   
收稿日期: 2018年02月23日    接受日期: 2018年03月19日    发表日期: 2019年01月17日
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摘 要

为深入发掘和筛选中国野生山胡椒种质资源,本研究利用 18 SSR 引物(5 叶绿体 SSR 13 SSR),以基本涵盖中国大陆自然分布区的 22 个自然群体共 303 份野生山胡椒种质为材料,进行 SSR 基因分型分析,并绘制出原始种质的亲缘关系图。结果表明,18 对引物共检测到 Na=88Ne 1.18~3.76He 0.14~0.74Ho 0~0.58I 0.30~1.52,以及 PIC .13~0.70STRUCTURE 分析和 UPGMA 聚类的结果都显示出 22 个自然群体适合被划分为三个亚类群。利用等位基因最大化(M 策略)和遗传距离最大化(SAGD)法分别至少要在 25% (71 份种质)15%取样比例下(45 份种质)构建的核心种质才能够在所有遗传多样性指标上代表原始种质的遗传多样性(t 检验不显著),并符合核心种质构建的标准。结合核心种质构建工作的同类研究,确定 SAGD (15%取样比例)是较适宜于构建山胡椒核心种质的方法。基于 nSSR 标记,SAGD 15%比例下构建的核心种质在 NaNe I 指标参数上的保留率分别达到了原始种质的 93.24%104.67%100.85%;基于 cpSSR 标记,与之对应的保留率分别为 85.14%107.45%108.82%。通过此法筛选出的 45 份核心种质材料能够一定程度地代表中国整个野生山胡椒种质资源的遗传多样性。研究结果可为其他对非作物型木本植物的核心种质构建,尤其是兼有无性与有性繁殖的物种提供参考。

关键词
山胡椒;SSR 标记;核心种质;聚类分析
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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