研究报告

鹰嘴豆 WOX 转录因子基因家族全基因组分析  

张洪涛1*
哈尔滨师范大学生命科学与技术学院, 黑龙江省分子细胞遗传与遗传育种重点实验室, 哈尔滨, 150025
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 3 篇   
收稿日期: 2018年02月21日    接受日期: 2018年03月19日    发表日期: 2018年06月28日
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摘 要

WOX 基因家族是植物中特有的转录因子家族,研究发现该基因家族调控植物生长发育的各个重要环节,本研究将在鹰嘴豆数据库中下载的 WOX 蛋白序列,利用 HUMMERSmart 等软件进行筛选,鉴定出 17 WOX 基因家族成员,利用信息学方法对这些家族成员的基本信息,包括分子量、蛋白长度、等电点等进行分析,并利用生物信息学软件对鹰嘴豆 WOX 基因家族进化关系、保守区域、基因结构等进行系统性分析,将鹰嘴豆 WOX 基因家族分为古代进化支、中间进化支和现代进化支,结构分析表明该家族的全基因组序列是高度保守的,在进化过程中呈多样性。利用荧光 PCR 技术分析在盐胁迫下,根中 WOX 基因家族成员在不同时间点的表达情况,发现CarWOX5CarWOX7 CarWOX11 与耐盐胁迫调控密切相关。本研究对鹰嘴豆 WOX 基因家族进行了全面、系统的生物信息学分析,以期为后续的功能验证研究奠定基础。

 

关键词
鹰嘴豆;WOX 基因家族;生物信息学
《分子植物育种》印刷版
• 第 16 卷
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