张瑶瑶 , 宋丽 , 刘伟 , 曹先爽 , 王煜炜 , 王进^*

国际竹藤中心, 国家林业局竹藤科学与技术重点实验室, 北京, 100102
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2018 年, 第 16卷, 第 11 篇   
收稿日期: 2018年02月11日    接受日期: 2018年03月02日    发表日期: 2019年01月16日

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本研究目的是克隆香樟法尼基焦磷酸合酶(farnesyl pyrophosphate synthase, FPPS)的 cDNA 序列，并开展生物信息学分析，为香樟植物萜类物质的合成及调控机理研究提供基础。本研究利用香樟转录组的测序数据，设计特异性 PCR 引物，应用反转录 PCR 技术扩增获得香樟 FPPS 基因，经生物信息学分析，对该基因编码的蛋白进行表征。香樟 FPPS 基因的开放读码框(ORF)序列全长为 1 053 bp，编码 350 个氨基酸，蛋白分子量为 40.42 kD，理论等电点为 5.25。香樟 FPPS 是一个定位于细胞质，不含信号肽的不稳定亲水性蛋白，具有类异戊二烯类化合物合酶的特征结构域并含有 7 个保守结构域，氨基酸序列二级结构主要为α- 螺旋。通过氨基酸序列的同源性分析发现，香樟 CcFPPS 的氨基酸序列与山苍子、陆地棉和野大豆等植物的 FPPS氨基酸序列有较高的同源性。分子进化树分析表明，香樟 CcFPPS 蛋白与樟科植物山苍子 FPPS 蛋白的亲缘关系最近。本研究首次成功从香樟中克隆了 CcFPPS 基因并进行了生物信息学分析，为进一步研究 CcFPPS基因在萜类合成调控的功能提供理论依据。

香樟；FPPS 基因；基因克隆；生物信息学分析；萜类物质